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CAG启动子，是CMV启动子（C），鸡β-肌动蛋白内含子（A）和兔β-珠蛋白的内含子区的组合体（G）。它是一个强启动子的组成型启动子，没有细胞组织特异性。

FLEX，或者称FLEx (“flip-excision”)，是和Cre配合控制目的基因表达的元件，一般由两对互不相容的Lox序列组成，特征序列是Lox2722r-间隔1-LoxP-GOIr-Lox2722-间隔2-LoxPr。当有Cre存在时，任一对Lox序列都有可能发生重组，因为每对Lox都是相反方向的，所以重组会导致他们之间的序列发生颠倒，例如Lox2722先发生重组会形成Lox2722r-GOI-LoxPr-间隔1r-Lox2722-间隔2-LoxPr，这时两个LoxP的方向由之前的相反变成相同，它们之间发生第二次重组就会使Lox2722缺失，形成Lox2722r-GOI-LoxPr，由于Lox2722r和LoxPr之间不能发生重组，目的基因的位置就固定下来。LoxP先发生重组，结果也是一样的。通常我们会插入目的基因使它的序列和启动子相反，也就是刚开始的时候不表达，Cre作用后目的基因开始表达。FLEX和DIO是非常接近的，除了所用的间隔1和间隔2序列有所不同。

Flp(flippase)是常用的位点特异DNA重组酶，克隆自酿酒酵母，由423个氨基酸组成，Flp的作用位点是FRT。一些Frt突变体也能被Flp识别，包括F3等，通常这些突变体只能与自身相同序列发生重组。在同一个DNA分子上，根据发生重组的两个FRT序列的方向不同，处于这两个序列之间的序列会发生缺失或是颠倒。